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郭可信先生是我國著名的電子顯微學和晶體學家,在國內(nèi)率先引入高分辨電子顯微鏡,開始從原子尺度直接觀察晶體結(jié)構(gòu)的研究。郭可信先生為我國的金屬材料物理研究以及電子顯微學研究事業(yè)培養(yǎng)了大量的人才,桃李滿天下。為繼承郭可信先生的遺志,為中國電子顯微學的持續(xù)發(fā)展做貢獻,2008年由郭可信先生的學生倡導發(fā)起,國內(nèi)外從事電鏡研究應用的華人學者經(jīng)過認真商討,決定每年舉辦一次郭可信電子顯微學和晶體學暑期學校,并以材料科學和生物學應用為主題輪流舉行。
2014年7月26日-27日,“第七屆郭可信電子顯微學和晶體學暑期學校”在中國科學院上海生命科學研究院生化與細胞所國家蛋白質(zhì)科學中心•上海(籌)舉辦。本期暑期學校為“2014冷凍電鏡(cryo-EM)三維分子成像國際研討會”的一個組成部分,著眼于冷凍電鏡相關實驗技術(shù)及計算軟件的實踐技術(shù)培訓,旨在培養(yǎng)我國生物冷凍電鏡高技術(shù)人才及年輕后備人才。
根據(jù)冷凍電鏡的技術(shù)特點,本期暑期學校分為了電鏡操作技術(shù)培訓和圖像處理技術(shù)培訓兩個部分。邀請了來自海外的知名專家學者進行講授培訓。
電鏡操作技術(shù)培訓
冷凍電鏡技術(shù)作為結(jié)構(gòu)生物學及細胞生物學的新興研究方法,在過去十幾年里技術(shù)上取得了長足的發(fā)展,最近幾年在國內(nèi)也得以推廣并取得極大進步,越來越多的研究小組關注這一技術(shù)的應用。
加州大學舊金山分校 程亦凡博士
來自加州大學舊金山分校的程亦凡博士介紹了冷凍電鏡的基本原理、儀器構(gòu)造、生物樣品制備、三維重構(gòu)的原理、以及電子晶體學、單顆粒三維重構(gòu)、電子斷層三維重構(gòu)技術(shù)的特點與應用等內(nèi)容。
布蘭迪斯大學 徐晨博士
布蘭迪斯大學的徐晨博士從冷凍電鏡設施的建立、冷凍電鏡樣品的制備和操作,以及當前電鏡操作的自動化、遠程控制等先進技術(shù)。最后,徐晨還介紹了新型圖像探測器—直接電子探測器的市場和應用情況。
匹茲堡大學醫(yī)學院 Peijun Zhang博士
匹茲堡大學醫(yī)學院的Peijun Zhang博士介紹了共聚焦顯微鏡與冷凍電鏡結(jié)合使用在活細胞檢測方面的應用。
美國斯克利普斯研究所 Anchi Cheng博士
來自美國斯克利普斯研究所的Anchi Cheng博士介紹了其參與研發(fā)的Leginon電鏡數(shù)據(jù)自動收集的軟件與方法。Leginon是目前應用比較成熟的單顆粒自動化數(shù)據(jù)收集軟件之一。
霍華德•休斯醫(yī)學研究所 Dan Shi博士
此外,還有來自霍華德•休斯醫(yī)學研究所的Dan Shi博士介紹了電子衍射數(shù)據(jù)收集的相關內(nèi)容。
圖像處理技術(shù)培訓
雖然近年來冷凍電鏡技術(shù)進入快速發(fā)展期,然而與其配套的圖像處理及三維重構(gòu)技術(shù)在國內(nèi)發(fā)展還相對滯后,一定程度上制約了該技術(shù)在我國的應用。此次培訓班專門開設了電鏡數(shù)據(jù)圖像處理及三維重構(gòu)技術(shù)課程,幫助學員系統(tǒng)全面地掌握最新的冷凍電鏡圖像處理技術(shù)和軟件。
美國Baylor醫(yī)學院 Steven Ludtke博士
EMAN2的開發(fā)者——美國Baylor醫(yī)學院的Steven Ludtke博士介紹了單顆粒冷凍電鏡三維重構(gòu)軟件EMAN2。1999年,Steven Ludtke博士等人推出了EMAN軟件的第一個版本,如今EMAN已成為世界上使用最廣泛、用于高分辨率單顆粒重構(gòu)的軟件之一。
英國劍橋MRC分子生物學實驗室 Sjors Scheres博士
英國劍橋MRC分子生物學實驗室的Sjors Scheres博士介紹了RELION軟件包,以及最大概然統(tǒng)計分析理論和貝葉斯理論在電鏡圖像分析和三維重構(gòu)中的應用。在最近解析的高分辨率電鏡結(jié)構(gòu)中,很多應用了RELION軟件包。
德國Jülich研究中心 Gunnar Schroder
德國Jülich研究中心的Gunnar Schroder博士介紹了DireX軟件包在電鏡三維密度圖限制下柔性建模、分析評估方法及其軟件的發(fā)展與應用。
圖像處理技術(shù)培訓現(xiàn)場
電鏡操作技術(shù)培訓現(xiàn)場
在整個培訓期間,除了邀請專家進行授課培訓外,還安排了充分的時間讓學員進行實際操作培訓,并由授課老師直接進行指導。接受培訓的學生們表示通過此次培訓對于冷凍電鏡及三維重構(gòu)技術(shù)有了更深入的了解和認識,對于自己日后的研究工作頗有幫助。(撰稿:秦麗娟)
附錄:郭可信電子顯微學和晶體學暑期學校的由來
郭可信先生是我國著名的電子顯微學和晶體學家,在國內(nèi)率先引入高分辨電子顯微鏡,開始從原子尺度直接觀察晶體結(jié)構(gòu)的研究。郭可信先生與錢臨照、柯俊先生等科學家發(fā)起創(chuàng)建了中國電子顯微鏡學會,并親任理事長。同時郭先生在國際科學界具有重要影響,曾任亞太地區(qū)電子顯微學會聯(lián)合會主席等,并且郭可信先生為我國的金屬材料物理研究以及電子顯微學研究事業(yè)培養(yǎng)了大量的人才,桃李滿天下。
為繼承郭可信先生的遺志,為中國電子顯微學的持續(xù)發(fā)展做貢獻,2008年由郭可信先生的學生倡導發(fā)起,國內(nèi)外從事電鏡研究應用的華人學者經(jīng)過認真商討,決定每年舉辦一次郭可信電子顯微學和晶體學暑期學校,并以材料科學和生物學應用為主題輪流舉行。每年的暑期學校都電鏡學習培訓班和學術(shù)研討會相結(jié)合的形式,一方面培養(yǎng)大家的電鏡基礎知識和操作技術(shù),另一方面能夠更好的了解國內(nèi)外電鏡應用的最新研究進展。
首屆郭可信電子顯微學和晶體學暑期學校在清華大學舉行,并舉辦“冷凍電鏡三維分子成像國際研討會”。此后,為了有系統(tǒng)持續(xù)性地推動冷凍電鏡研究領域的交流與發(fā)展,加強我國科研的國際交流合作,使青年學者有機會與該領域權(quán)威科學家面對面交流,并得到高層次的培訓,在中國每兩年舉辦一次生物領域的“郭可信電子顯微學與晶體學暑期學校”及“冷凍電鏡三維分子成像國際研討會”,第二屆會議2010年在中科院生物物理所舉辦;第三屆會議2012年在中國科技大學舉辦。
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